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(一)荧光色素

1. 异硫氰酸荧光素(FITC)：呈现明亮的黄绿色荧光。

2. 四乙基罗丹明(RB200)：呈橘红色荧光。

3. 四甲基异硫氰酸罗丹明(TRITC)：呈橙红色荧光。

4. 藻红蛋白(R-RE)：呈明亮的橙色荧光。

(二)其他荧光物质

1. 镧系螯合物：其中以Eu3+应用最广。Eu3+螯合物的激发光波长范围宽，发射光波长范围窄，荧光衰变时间长，最适合用于时间分辨荧光免疫测定。

2. 酶作用后产生荧光的物质：4-甲基伞酮-β-D半乳糖苷本身无荧光，受β-半乳糖苷酶的作用分解成4-甲基伞酮，后者可发出荧光。其他如碱性磷酸酶的底物是4-甲基伞酮磷酸盐，辣根过氧化物酶的底物是对羟基苯乙酸等。