新罕布什尔州达勒姆市-新罕布什尔大学的研究人员已经发现了一种基于RNA的病毒中的新途径，该途径中的抑制剂(如药物治疗)没有结合。这一发现可能有助于了解这些抑制剂的反应方式，并有可能帮助开发针对高死亡率病毒的新一代药物，例如HIV-1，寨卡病毒，埃博拉病毒和SARS-CoV2(引起COVID-19的病毒)。

化学工程副教授哈里斯·瓦希斯(Harish Vashisth)说：“当我们刚开始这项研究时，我们从未想到我们会陷入由RNA病毒引起的大流行之中。”“但是随着这些类型病毒的出现，我们的发现有望使人们对病毒RNA如何与抑制剂相互作用并被用于设计更好的治疗方法有更深入的了解。”

与人类由一系列不同的染色体(称为DNA)组成的方式类似，许多病毒具有RNA分子的遗传组成。这些基于RNA的基因组包含潜在的位点，抑制剂可在这些位点附着并灭活病毒。药物开发中的挑战之一可能是病毒基因组的波动，这可能会阻止抑制剂的附着。

在他们的论文中，最近发表在《物理化学快报》上，研究人员专门研究了HIV-1病毒的RNA片段及其与配体/抑制剂(一种已知会干扰病毒复制过程的复杂化合物)的相互作用。使用计算机建模，研究人员发现了几种罕见事件中抑制剂与病毒RNA脱结合的途径，这些事件出乎意料地显示出结合口袋中许多构成RNA组成部分的协调运动。科学家们专注于HIV-1 RNA基因组的结构元素，因为它们被认为是研究多种RNA病毒相同过程的良好模型。

Vashisth说：“我们观察到了抑制剂结合/解结合过程中涉及的罕见碱基翻转事件，这些事件提供了该过程潜在机制的新细节。”“我们的希望是，这为传统上专注于静态生物分子结构的领域增加了新的可能性，并带来了新的药物。”