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(一)直接法：将酶直接标记在特异性抗体上，与组织细胞内相应的抗原进行特异性反应，形成抗原-抗体-酶复合物，最后用酶底物显色。直接法的优点在于操作简便及特异性强，缺点是敏感性低，制备的抗体种类有限。

(二)间接法：将酶标记在第二抗体上，先将第一抗体(特异性抗体)与相应的组织抗原结合，形成抗原抗体复合物，再用第二抗体(酶标记的抗体)与复合物中的特异性抗体结合，形成抗原-抗体-酶标抗体复合物，最后用底物显色剂显色。间接法的优点是检测敏感性高，制备一种酶标二抗可用于检测多种抗原或抗体。缺点是特异性不如直接法，而且操作较为繁琐。