宾夕法尼亚大学公园-通过重建SARS-CoV-2的进化史，SARS-CoV-2是导致COVID-19大流行的病毒，由，欧洲和美国科学家组成的国际研究小组发现，这种谱系产生了这种病毒已经在蝙蝠中传播了数十年，并且可能包括其他能够感染人类的​​病毒。这些发现对于预防由该血统引起的未来大流行具有重要意义。

宾夕法尼亚州立大学生物学副教授Maciej Boni说：“冠状病毒具有高度重组的遗传物质，这意味着该病毒基因组的不同区域可以来自多种来源。”“这使得重建SARS-CoV-2的起源变得困难。您必须确定所有正在重组的区域并追踪其历史。为此，我们组建了一支在重组，系统发育约会，病毒方面具有专业知识的多元化团队采样以及分子和病毒的进化。”

该团队使用三种不同的生物信息学方法来识别和去除SARS-CoV-2基因组内的重组区域。接下来，他们重建了非重组区的系统发育历史，并将它们相互比较，以查看过去哪些特定病毒参与了重组事件。他们能够重建SARS-CoV-2及其最接近的已知蝙蝠和穿山甲病毒之间的进化关系。他们的发现今天(7月28日)发表在《自然微生物学》上。

研究人员发现，SARS-CoV-2所属的病毒谱系与其他蝙蝠病毒不同，大约在40-70年前。重要的是，尽管SARS-CoV-2与RaTG13冠状病毒在基因上相似(约96%)，该病毒是从2013年在云南省的一条犀牛马蹄蝠中取样的，但研究小组发现它在相当长的时间内与RaTG13分叉以前是1969年

进化和计算病毒学系首席研究员Philippe Lemey表示：“在解开重组历史后，估计差异时间的能力，这是我们在这项合作中开发的，可能会导致洞悉许多不同的病毒病原体。鲁汶

研究小组发现，SARS-CoV-2与亲戚共有的较旧特征之一是位于Spike蛋白上的受体结合域(RBD)，这使病毒能够识别并结合人细胞表面的受体。 。

格拉斯哥大学MRC大学病毒研究中心计算病毒学教授戴维·罗伯逊说：“这意味着其他能够感染人类的​​病毒正在的马蹄蝠中传播。”

这些病毒是否能够直接从蝙蝠跳入人类，还是需要中间物种才能实现这一飞跃?根据罗伯逊的说法，对于SARS-CoV-2，其他研究小组错误地提出穿山甲发生了重要的进化变化。

罗伯逊说：“到目前为止，SARS-CoV-2的RBD序列仅在少数穿山甲病毒中被发现。”“此外，还认为在SARS-CoV-2的另一个近亲蝙蝠中还没有发现另一个关键特征，该特征有助于SARS-CoV-2感染人类的​​能力-Spike蛋白中的多价切割位点插入- 2病毒，尽管穿山甲可能充当了促进SARS-CoV-2传播给人类的中间宿主，但没有证据表明穿山甲感染是蝙蝠病毒进入人类的必要条件。我们的研究表明，SARS-CoV-2可能会进化出人类和穿山甲在上呼吸道中复制的能力。”